公司下屬的運河公司社區衛生服務中心下設清浦區前進中路衛生服務站、南新村養老康復中心、運河公司北新村門診部，是淮安市首批職工醫保定點醫療機構。同時也是清浦區、清河區職工醫保定點、淮安市城鎮居民醫療統籌定點醫療機構。開設內科、外科、中醫、康復、口腔、放射、超聲、檢驗等科室，市二院各科專家長期輪流坐診，病房開設床位60張，是區域首屈一指的衛生服務中心。